Братский государственный университет реализует образовательную деятельность в системе послевузовского профессионального образования по 24 научным специальностям десяти отраслей наук.

Во исполнение приказа Министерства образования и науки Российской Федерации от 16 ноября 2009 года № 603 в соответствии с Номенклатурой специальностей научных работников, утвержденной приказом Министерства образования и науки Российской Федерации от 25 февраля 2009 года № 59, Братским государственным университетом в 2010 году была проведена работа по лицензированию пяти новых образовательных программ послевузовского профессионального образования. Это экология (биологические науки); биологические ресурсы (биологические науки, сельскохозяйственные науки); технология и оборудование механической и физико-технической обработки (технические науки); лесоведение, лесоводство, лесоустройство и лесная таксация (сельскохозяйственные науки); агролесомелиорация, защитное лесоразведение и озеленение населенных пунктов, лесные пожары и борьба с ними (сельскохозяйственные науки).

В результате слаженной, творческой деятельности, возглавляемой проректором по научной работе П.М. Огаром и проведенной заведующим кафедрой лесоинженерного дела Е.М. Руновой, заведующим кафедрой технологии машиностроения А.С. Янюшкиным, начальником Управления аспирантуры и докторантуры Е.С. Юдиной и ведущим документоведом УАД А.А. Маркатюк, Братский государственный университет успешно прошел лицензионную экспертизу.

На основании приказа Федеральной службы по надзору в сфере образования и науки от 27 января 2011 года № 129 наш университет с 2011 года имеет право ведения образовательной деятельности в системе послевузовского образования по перечисленным научным специальностям.

В 2011 году ФГБОУ ВПО «БрГУ» проводит прием и приглашает желающих к поступлению в аспирантуру по 26 научным специальностям, включая вновь открытые.